MICROBIOLOGY AND NATURE

Phenotypic and genotypic characterization of antibiotic resistance in Staphylococcus aureus strains isolated from schoolchildren skin lesions in Bouaké, Centre Côte d’Ivoire
WAYORO Oby Zéphirin^1,2 , ANOH Etilé Augustin², TADET Juste Olivier^2,3, BOKA Irié Sara Ester², TUO Marie Nonfra², KARIDIOULA Safiatou^1,2, COULIBALY Baba⁴, DIARRASSOUBA Abdoulaye^2,3, TOURÉ Sounan Fidèle², GAWA Kokora Junior², CISSÉ Amadou², MONEMO Pacôme^2,3, N’GUESSAN Aya Nicaise epse Okoubo¹ , AKOUA-Koffi Chantal<sup>2,3

1</sup>Laboratoire Biologie Environnement et Santé, UFR Biosciences, Université Félix Houphouët-Boigny, 01 BP V 34 Abidjan, Côte d’Ivoire
²Centre Hospitalier et Universitaire de Bouaké, Laboratoire Bactériologie-Virologie
³UFR des Sciences Médical, Université Alassane Ouattara, BP 1174 Bouaké
⁴Institut National de la Santé Publique, Institut Pierre Richet, Bouaké

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ABSTRACT

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Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) skin infections represent a real problem in the therapeutic management of schoolchildren. In this study, we investigated the epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) colonization in schoolchildren skin lesions in Bouaké, Centre Côte d’Ivoire. S. aureus isolates were examined for drugs susceptibility and mecA, tetK and tetM genes presence. An analytical cross-sectional study of skin lesions in schoolchildren was conducted from November 2018 to May 2019. Skin lesion swabs were analyzed using conventional bacteriological techniques. Isolated S. aureus strains were tested with standard antibiotics using the Kirby-Bauer technique according to CASFM/EUCAST 2019 recommendations. PCR was performed for the detection of mecA, tetK and tetM genes. In total, 199 strains of S. aureus were isolated of which 68 (34.17 %) were MRSA and 169 (85 %) were tetracycline resistant. Of the MRSA strains, 40 (58.83%) were mecA positive, 29 (42.65 %) harbored the tetK gene, 13 (19.12 %) the tetM gene and 6 (8.83 %) all three genes. Ninety-nine (58.57 %) of the tetracycline-resistant strains were tetK positive, 40 (23.67 %) were tetM positive and 23 (13.60 %) had both tetK and tetM genes. The resistance rate of the tetK and tetM genes associated with the mecA gene was 29.29 % and 30 % respectively. In conclusion, schoolchildren community acquired MRSA isolates suggested that the skin of schoolchildren with lesion may represent a significant reservoir of MRSA colonization in the community. This calls for vigilance of clinicians and microbiologists for the emergence of new epidemics in schoolchildren communities.

Keywords: Skin lesions, MRSA, mecA, tetK and tetM genes, schoolchildren

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RESUME

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Les infections cutanées à Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) représentent un réel problème dans la prise en charge thérapeutique des écoliers. Dans cette étude, nous avons étudié l'épidémiologie de la colonisation par S. aureus résistant à la méthicilline (SARM) dans les lésions cutanées des écoliers à Bouaké, Centre Côte d'Ivoire. Des isolats de S. aureus ont été examinés pour la sensibilité aux médicaments et la présence des gènes mecA, tetK et tetM. Une étude transversale analytique des lésions cutanées chez les écoliers a été menée de novembre 2018 à mai 2019. Des écouvillonnages de lésions cutanées ont été analysés à l'aide de techniques bactériologiques conventionnelles. Des souches isolées de S. aureus ont été testées avec des antibiotiques standards en utilisant la technique de Kirby-Bauer selon les recommandations CASFM/EUCAST 2019. La PCR a été réalisée pour la détection des gènes mecA, tetK et tetM. Au total, 199 souches de S. aureus ont été isolées dont 68 (34,17 %) étaient des SARM et 169 (85 %) étaient résistantes à la tétracycline. Parmi les souches de SARM, 40 (58,83 %) étaient mecA positives, 29 (42,65 %) portaient le gène tetK, 13 (19,12 %) le gène tetM et 6 (8,83 %) les trois gènes. Quatre-vingt-dix-neuf (58,57 %) des souches résistantes à la tétracycline étaient tetK positives, 40 (23,67 %) étaient tetM positives et 23 (13,60 %) avaient à la fois les gènes tetK et tetM. Le taux de résistance des gènes tetK et tetM associés au gène mecA était respectivement de 29,29 % et 30 %. En conclusion, les isolats de SARM acquis dans la communauté des écoliers suggèrent que la peau des écoliers présentant une lésion peut représenter un réservoir important de colonisation de SARM dans la communauté. Cela appelle à la vigilance des cliniciens et des microbiologistes face à l'émergence de nouvelles épidémies dans les communautés scolaires.

Mots-clés: Infections cutanées, SARM, genes mecA, tetK and tetM, écoliers.

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doi.org/10.26167/w7y3-z238

Received 21^st May 2021  Revised 3^rd August 2021  Accepted 8^th August 2021   Published 20^th August 2021