A highly diverse Acetic Acid Bacterial community is involved in Cocoa fermenting process in Côte d’Ivoire

Kouamé, Liliane M.; Goualié, Bernadette G.; Soumahoro, Souleymane; Ouattara, Honoré G.; Niamke, Sébastien L.

A highly diverse Acetic Acid Bacterial community is involved in Cocoa fermenting process in Côte d’Ivoire
Liliane M. Kouamé ¹ Bernadette G. Goualié² Souleymane Soumahoro ¹ Honoré G. Ouattara ² Sébastien L Niamke²

¹Institut de Gestion Agropastorale, Korhogo, Côte d’Ivoire
²Laboratoire de Biotechnologies, Unité de Formation et de Recherche en Biosciences, Université Félix Houphouët-Boigny, Abidjan, Cote d’Ivoire

ABSTRACT

Cocoa fermentation is led by a succession of complex microbial communities where acetic acid bacteria play key roles for cocoa quality at the end of the process. In this study, the molecular diversity of acetic acid bacteria (AAB) involved in cocoa bean fermentation in six major cocoa producing regions in Côte d’Ivoire was estimated. A total of 694 acetic acid bacteria isolated during six days of fermentation was identified using 16S RNA gene analyses. It was revealed that the AAB fermenting community in Côte d’Ivoire consisted of seven (07) species with a predominance of A. pasterianus, and A. tropicalis. Moreover, phylogenetic analysis indicated an intraspecific diversity among A. tropicalis isolated strains. In addition, it was shown that among the 694 isolates, 222 had a low acetic acid capacity production; while 343 had average capacity and 129 higher capacity. All these data provide new insight about the AAB strains involved in cocoa fermentation in Côte d'Ivoire that could be exploited for selecting appropriate starter cultures to improve this process.

Keywords: Keywords: Cocoa Fermentation, Acetic acid Bacteria diversity, high Acetic Acid production capacity, Côte d’Ivoire

RESUME

Dans cette étude, la diversité moléculaire des bactéries acétique impliquées dans la fermentation des fèves de cacao de six grandes régions productrices de cacao en Côte d’Ivoire a été estimée. Un total de 694 bactéries acétiques a été isolé pendant six jours de fermentation ont été identifiées à l'aide du gène de l'ARN 16S. Les résultats ont montré que la flore de bactéries acétiques impliquée dans la fermentation du cacao en Côte d’Ivoire était composée de sept (07) espèces avec une prédominance de A. Pasterianus, et A. tropicalis. De plus, l'analyse phylogénétique a indiqué une diversité intraspécifique parmi les souches de A. tropicalis. Par ailleurs, les résultats ont montré que parmi ces 694 isolats, 222 étaient de faibles producteurs d'acide acétique, alors que 343 étaient des producteurs moyens et 129 étaient de forts producteurs d'acide acétique. Toutes ces données fournissent de nouveaux indices sur les propriétés des souches de bactéries acétiques impliquées dans la fermentation du cacao en Côte d'Ivoire et pourraient être exploitées pour la sélection de souches starters nécessaire à l'amélioration de ce processus

Mots clés: Fermentation du cacao, diversité des bactéries acétiques, forte capacité de production d'acide acétique, Côte d’Ivoire

https://doi.org/10.26167/r4pj-dm44

Received: Nov 17th 2019 Revised:Jan 16th 2020 Accepted:March 02th 2020 Published:March 09th 2020