ISSN:2664-388X

Antifungal activities of endophytic fungi isolated from plantain tissues on Fusarium solani a potential pathogen
Amoa Amoa Jésus 1 Fotso Beaulys1 Zézé Adolphe 1

1 1Laboratoire de Biotechnologies Végétale et Microbienne, Unité Mixte de Recherche et d’Innovation en Sciences Agronomiques et Génie Rural, Institut National Polytechnique Felix Houphouët-Boigny (INPHB, Côte d’Ivoire), BP 1093 Yamoussoukro Côte d'Ivoire.

ABSTRACT


Endophytic fungi are part of microbial community found in various types of plant tissues and display a range of symbiotic interactions with the plant host, including plantain species. They are sustainable and less harmful alternatives to chemicals in controlling pathogens. Therefore, this study was aimed to isolate the endophytic fungal communities associated with the plantain Corn 1 in order to use them for the management of root rot disease incidence. Five endophytic fungi were isolated from healthy and symptomatic parts of the plantain variety Corn1 from farms in Southern Côte d’Ivoire. The analyses of the ITS region sequences revealed that the isolates from the healthy parts LBVM Ba.0001 and LBVM Ba.0006 had 99% and 100% homology with respectively Neosartorya laciniosa (FR733875.1) and Talaromyces assiutensis (KM458833.1). The strains LBVM Ba.0002 and LBVM Ba.0003 isolated from the symptomatic parts had 99% Fusarium solani (KT366735.1) while LBVM Ba.0005 had 100% homology with Nectria haematococca (AY310442.1). Both endophytes isolates LBVM Ba.0001 and LBVM Ba.0006 were tested for their ability to inhibit the growth of Fusarium solani using dual culture assays. The endophytic fungi inhibited Fusarium solani growth significantly (P ≤ 0.05) under in-vitro conditions. Neosartorya laciniosa showed the best biocontrol effect on Fusarium solani (IC50 = 0.8 g/L and IC90 = 7.6 g/L), compared to Talaromyces assiutensis (IC50 = 0.8 g/L and IC90 = 7.6 g/L)

Keywords: Bananas; Endophytes; Root rot disease; Biocontrol; Côte d’Ivoire


RESUME


Les champignons endophytes font partie de la communauté microbienne présente dans divers types de tissus végétaux et présentent une gamme d'interactions symbiotiques avec la plante hôte, y compris les espèces de bananier. Leur utilisation est une alternative durable et moins nocive aux produits chimiques dans le contrôle des agents pathogènes. Par conséquent, cette étude visait à isoler les communautés fongiques endophytes associées à la variété de plantain Corn1 afin de les utiliser pour la gestion de l’incidence de la pourriture des racines. Cinq souches de champignons endophytes ont été isolées de parties végétales saines et symptomatiques de champs de la variété Corn1 au Sud de la Côte d’Ivoire. Les analyses des séquences de la région ITS ont révélé que les isolats LBVM Ba.0001 et LBVM Ba.0006 présentaient respectivement une homologie de 99% avec Neosartorya laciniosa (FR733875.1) et avec Talaromyces assiutensis (KM458833.1) de la base de données GenBank. Les isolats LBVM Ba.0002 et LBVM Ba.0003 présentaient une homologie de 99% avec Fusarium solani (KT366735.1), tandis que l'isolat LBVM Ba.0005 présentait une homologie de 100% avec Nectria haematococca (AY310442.1). Les deux isolats d'endophytes LBVM Ba.0001 et LBVM Ba.0006 ont été testés pour déterminer leur capacité à inhiber la croissance de Fusarium solani à l'aide de tests de double culture. Les champignons endophytes ont fortement inhibé la croissance de Fusarium solani (P ≤ 0,05) dans des conditions in vitro. Neosartorya laciniosa a montré le meilleur effet de biocontrôle sur Fusarium solani (IC50 = 0,8 g / L et IC90 = 7,6 g / L) par rapport à Talaromyces assiutensis (IC50 = 0,8 g / L et IC90 = 7,6 g / L).

Mots clés: plantain; endophytes; Maladie de la pourriture des racines; Biocontrôle; Côte d'Ivoire


doi.org/10.26167/spsf-d337

Received: 30th Sept 2019   Revised: 5th Dec 2019  Accepted: 15th Dec 2019  Published:31st Jan 2020



VOLUME 1

Issue 3


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